MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021892	ATG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322503
2	NC_021892	GTG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322503
3	NC_021892	TCC	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322503
4	NC_021892	AGC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322503
5	NC_021892	T	6	6	1382	1387	0 %	100 %	0 %	0 %	527322503
6	NC_021892	AGC	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322503
7	NC_021892	AAG	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322503
8	NC_021892	TAC	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322503
9	NC_021892	GCT	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322503
10	NC_021892	AGTA	2	8	1487	1494	50 %	25 %	25 %	0 %	527322503
11	NC_021892	AAC	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322503
12	NC_021892	AGA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322503
13	NC_021892	AGA	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322504
14	NC_021892	ATC	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322504
15	NC_021892	TGC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322504
16	NC_021892	ATGA	2	8	1891	1898	50 %	25 %	25 %	0 %	527322504
17	NC_021892	GATA	2	8	1929	1936	50 %	25 %	25 %	0 %	527322504
18	NC_021892	CAT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322504
19	NC_021892	AGA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322504
20	NC_021892	AAG	2	6	2024	2029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322504
21	NC_021892	GGA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322504
22	NC_021892	AG	3	6	2151	2156	50 %	0 %	50 %	0 %	527322505
23	NC_021892	ATC	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322505
24	NC_021892	TTTC	2	8	2226	2233	0 %	75 %	0 %	25 %	527322505
25	NC_021892	ATA	2	6	2338	2343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322505
26	NC_021892	AAC	2	6	2363	2368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322505
27	NC_021892	GGT	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322505
28	NC_021892	AAT	2	6	2523	2528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322505
29	NC_021892	TTC	2	6	2558	2563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322505
30	NC_021892	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
31	NC_021892	GGA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322505
32	NC_021892	CAG	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
33	NC_021892	GTT	2	6	2661	2666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322505
34	NC_021892	GGT	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322505
35	NC_021892	GA	3	6	2819	2824	50 %	0 %	50 %	0 %	527322505
36	NC_021892	T	6	6	2826	2831	0 %	100 %	0 %	0 %	527322505
37	NC_021892	AAG	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
38	NC_021892	ATT	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322505
39	NC_021892	TTG	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322505
40	NC_021892	CATG	2	8	3107	3114	25 %	25 %	25 %	25 %	527322505
41	NC_021892	AAG	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
42	NC_021892	AAG	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
43	NC_021892	CAG	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
44	NC_021892	GCT	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322505
45	NC_021892	TGTGA	2	10	3279	3288	20 %	40 %	40 %	0 %	527322505
46	NC_021892	TTCC	2	8	3412	3419	0 %	50 %	0 %	50 %	527322505
47	NC_021892	AAG	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322505
48	NC_021892	CAG	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322505
49	NC_021892	GGA	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322505
50	NC_021892	AAT	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322505
51	NC_021892	TTGAA	2	10	3635	3644	40 %	40 %	20 %	0 %	527322506
52	NC_021892	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322506
53	NC_021892	TGA	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322506
54	NC_021892	TTTA	2	8	3810	3817	25 %	75 %	0 %	0 %	527322506
55	NC_021892	GTA	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322506
56	NC_021892	GAGAA	2	10	3929	3938	60 %	0 %	40 %	0 %	527322506
57	NC_021892	AGA	2	6	3966	3971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322506
58	NC_021892	ATCC	2	8	4110	4117	25 %	25 %	0 %	50 %	527322506
59	NC_021892	GAA	2	6	4150	4155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322506
60	NC_021892	CGT	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322506
61	NC_021892	A	7	7	4326	4332	100 %	0 %	0 %	0 %	527322506
62	NC_021892	GTT	2	6	4333	4338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322506
63	NC_021892	GAAAA	2	10	4366	4375	80 %	0 %	20 %	0 %	527322506
64	NC_021892	A	7	7	4372	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	527322506
65	NC_021892	TGA	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322506
66	NC_021892	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	527322506
67	NC_021892	TTACA	2	10	4521	4530	40 %	40 %	0 %	20 %	527322506
68	NC_021892	TTG	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322506
69	NC_021892	TTC	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322506
70	NC_021892	TCT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322506
71	NC_021892	AGA	2	6	4818	4823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322506
72	NC_021892	GTT	2	6	4845	4850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322506
73	NC_021892	GACG	2	8	4857	4864	25 %	0 %	50 %	25 %	527322506
74	NC_021892	GGT	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322506
75	NC_021892	AAAGCT	2	12	4939	4950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527322506
76	NC_021892	TTGG	2	8	4960	4967	0 %	50 %	50 %	0 %	527322506
77	NC_021892	CTC	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322506
78	NC_021892	AGC	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322506
79	NC_021892	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322507
80	NC_021892	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322507
81	NC_021892	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322507
82	NC_021892	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	527322507
83	NC_021892	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322507
84	NC_021892	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	527322507
85	NC_021892	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	527322507
86	NC_021892	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322507
87	NC_021892	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
88	NC_021892	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	527322507
89	NC_021892	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	527322507
90	NC_021892	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
91	NC_021892	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322507
92	NC_021892	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
93	NC_021892	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322507
94	NC_021892	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322507
95	NC_021892	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322507
96	NC_021892	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	527322507
97	NC_021892	T	6	6	5608	5613	0 %	100 %	0 %	0 %	527322507
98	NC_021892	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322507
99	NC_021892	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322507
100	NC_021892	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	527322507
101	NC_021892	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322507
102	NC_021892	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322507
103	NC_021892	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322507
104	NC_021892	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	527322507
105	NC_021892	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	527322507
106	NC_021892	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322508
107	NC_021892	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322508
108	NC_021892	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	527322508
109	NC_021892	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	527322508
110	NC_021892	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322508
111	NC_021892	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322508
112	NC_021892	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322508
113	NC_021892	TCG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322509
114	NC_021892	TCC	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322509
115	NC_021892	GTT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322509
116	NC_021892	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	527322509
117	NC_021892	T	6	6	7682	7687	0 %	100 %	0 %	0 %	527322509
118	NC_021892	TGGTA	2	10	7689	7698	20 %	40 %	40 %	0 %	527322509
119	NC_021892	AAGC	2	8	7819	7826	50 %	0 %	25 %	25 %	527322509
120	NC_021892	TTA	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322509
121	NC_021892	A	6	6	7966	7971	100 %	0 %	0 %	0 %	527322509
122	NC_021892	T	6	6	8051	8056	0 %	100 %	0 %	0 %	527322509
123	NC_021892	TTC	2	6	8157	8162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322509
124	NC_021892	ATTG	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	527322510
125	NC_021892	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322510
126	NC_021892	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	527322510
127	NC_021892	ACC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322510
128	NC_021892	CTT	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322510
129	NC_021892	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	527322510
130	NC_021892	GAG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322510
131	NC_021892	ATA	2	6	8579	8584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322510
132	NC_021892	GT	3	6	8590	8595	0 %	50 %	50 %	0 %	527322510
133	NC_021892	AGG	2	6	8603	8608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322510
134	NC_021892	AGCG	2	8	8684	8691	25 %	0 %	50 %	25 %	527322510
135	NC_021892	AAAG	2	8	8705	8712	75 %	0 %	25 %	0 %	527322510
136	NC_021892	GAA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322510
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143	NC_021892	CTTT	2	8	9045	9052	0 %	75 %	0 %	25 %	527322510
144	NC_021892	GTT	2	6	9057	9062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322510
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158	NC_021892	TCG	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322511
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263	NC_021892	TGT	2	6	14990	14995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322516
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265	NC_021892	TTTC	2	8	15075	15082	0 %	75 %	0 %	25 %	527322516
266	NC_021892	TCA	2	6	15157	15162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322516
267	NC_021892	GTA	2	6	15283	15288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322516
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269	NC_021892	TAT	2	6	15463	15468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322516
270	NC_021892	AAAT	2	8	15557	15564	75 %	25 %	0 %	0 %	527322516
271	NC_021892	TCA	2	6	15694	15699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322516
272	NC_021892	TTA	2	6	15702	15707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322516
273	NC_021892	GTA	2	6	15711	15716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322516
274	NC_021892	AG	3	6	15742	15747	50 %	0 %	50 %	0 %	527322516
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299	NC_021892	A	6	6	16861	16866	100 %	0 %	0 %	0 %	527322517
300	NC_021892	GAAGG	2	10	16901	16910	40 %	0 %	60 %	0 %	527322517
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377	NC_021892	CT	4	8	21914	21921	0 %	50 %	0 %	50 %	527322522
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381	NC_021892	TCT	2	6	22076	22081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322522
382	NC_021892	AT	3	6	22184	22189	50 %	50 %	0 %	0 %	527322522
383	NC_021892	TTG	2	6	22270	22275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322522
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385	NC_021892	T	6	6	22416	22421	0 %	100 %	0 %	0 %	527322522
386	NC_021892	AT	3	6	22508	22513	50 %	50 %	0 %	0 %	527322522
387	NC_021892	CTG	2	6	22519	22524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322522
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391	NC_021892	CATT	2	8	22700	22707	25 %	50 %	0 %	25 %	527322522
392	NC_021892	AGA	2	6	22879	22884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322522
393	NC_021892	TGA	2	6	22910	22915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322522
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